本发明公开了一种利用一组SSR引物鉴定陆地棉种质资源的方法及核心引物组合属于分子遗传技术领域。该组引物包括陆地棉A,D亚基因组各13条染色体的186对SSR核心引物。这些引物退火温度基本一致,均匀分布在26条染色体上,条带清晰,扩增效果比较好,能有效区分不同陆地棉种质间的差异,可作为棉花种质资源鉴定,分子指纹分析的核心引物。该方法对棉花种质资源的遗传多样性分析,指纹图谱构建,品种真伪性,纯度鉴定等都具有现实意义。