本发明涉及生物农药领域,具体涉及来源于雷公藤的植物杀菌剂其制备方法和应用。所述杀菌剂包括97wt%~99wt%的雷公藤提取物和1wt%~3wt%的有机硅表面活性剂。该杀菌剂能有效抑制棉花黄萎病病原菌丝生长和病原孢子萌发,进而有效防治棉花黄萎病,为有效防治棉花黄萎病提供了一种高效、低毒、低残留的植物源农药。