一、职能与支撑部门 综合办公室(党委办公室) 科技与成果转化处 人事处 财务资产处 基建条件处 科技传播与产业发展中心 创新促进中心
二、科研部门 油菜遗传育种研究室 大豆研究室 花生研究室 芝麻与特色油料研究室 种质资源学研究室 基因组学与分子生物学研究室 基因工程与转基因安全评价研究室 环境生物学研究室 产品加工与营养学研究室 质量标准与食品安全研究室